Yüzeyde, dipeptitler veren peptit bağlarının oluşumu basit bir kimyasal işlemdir.Bu, iki amino asit bileşeninin susuz haldeyken bir peptid bağı, bir amid bağı ile bağlandığı anlamına gelir.
Peptit bağı oluşumu, bir amino asidin ılımlı reaksiyon koşulları altında aktivasyonudur.(A) karboksil kısmı, ikinci amino asit (B) Nükleofilik olarak aktifleştirilmiş karboksil kısmı daha sonra dipeptidi (AB) oluşturur."Karboksil bileşeni (A) korunmazsa peptit bağının oluşumu kontrol edilemez."Doğrusal ve siklik peptitler gibi yan ürünler, AB hedef bileşikleri ile karıştırılabilir.Bu nedenle, peptit bağı oluşumunda yer almayan tüm fonksiyonel grupların, peptit sentezi sırasında geçici olarak tersine çevrilebilir bir şekilde korunması gerekir.
Yani, peptit sentezi (her bir peptit bağının oluşumu) üç toplama adımını içerir.
İlk adım, korunması gereken bazı amino asitleri hazırlamaktır ve amino asitlerin zwitteriyonik yapısı artık mevcut değildir.
İkinci adım, N-korumalı amino asidin karboksil grubunun ilk önce aktif ara maddeye aktive edildiği ve ardından peptit bağının oluşturulduğu peptid bağlarını oluşturmak için iki aşamalı bir reaksiyondur.Bu birleşik reaksiyon, tek adımlı bir reaksiyon veya iki ardışık reaksiyon olarak gerçekleşebilir.
Üçüncü adım, koruyucu bazın seçici olarak çıkarılması veya tamamen çıkarılmasıdır.Her ne kadar tüm uzaklaştırma ancak tüm peptit zincirleri bir araya getirildikten sonra gerçekleşebilse de, peptit sentezinin devam etmesi için koruyucu grupların seçici olarak uzaklaştırılması da gereklidir.
Çünkü 10 amino asit (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec ve Cys) seçici koruma gerektiren yan zincir fonksiyonel grupları içerdiğinden peptit sentezini daha karmaşık hale getirir.Seçiciliğe ilişkin farklı gereksinimler nedeniyle geçici ve yarı kalıcı koruma temelleri birbirinden ayrılmalıdır.Bir sonraki adımda amino asit veya karboksil fonksiyonel gruplarının geçici korumasını yansıtmak için geçici koruma grupları kullanılır.Yarı kalıcı koruyucu gruplar, önceden oluşturulmuş peptit bağlarına veya amino asit yan zincirlerine müdahale edilmeden, bazen sentez sırasında çıkarılır.
"İdeal olarak, karboksil bileşeninin aktivasyonu ve ardından peptit bağlarının oluşumu (bağlanma reaksiyonları), rasemik veya yan ürün oluşumu olmadan hızlı olmalı ve yüksek verim elde etmek için molar reaktanlar uygulanmalıdır."Ne yazık ki, kimyasal birleştirme yöntemlerinden hiçbiri bu gereklilikleri karşılamamaktadır ve çok azı pratik sentez için uygundur.
Peptit sentezi sırasında, çeşitli reaksiyonlarda yer alan fonksiyonel gruplar genellikle manuel merkeze bağlanır; glisin tek istisnadır ve potansiyel bir rotasyon riski vardır.
Peptit sentezi döngüsünün son adımı tüm koruyucu grupların uzaklaştırılmasıdır.Dipeptit sentezinde korumanın tamamen ortadan kaldırılması gerekliliğinin yanı sıra, koruyucu grupların seçici olarak uzaklaştırılması, peptit zincirinin uzatılması için de önemlidir.Sentetik stratejiler dikkatlice planlanmalıdır.Stratejik seçime bağlı olarak N, a-amino veya karboksil koruma gruplarını seçici olarak çıkarabilir.“Strateji” terimi, tek tek amino asitlerin yoğunlaşma reaksiyonlarının sırasını ifade eder.Genel olarak kademeli sentez ile parça yoğunlaşması arasında bir fark vardır.Peptit sentezi ("geleneksel sentez" olarak da bilinir) çözelti içinde gerçekleşir.Çoğu durumda, peptit zincirinin kademeli olarak uzatılması, yalnızca daha kısa fragmanların sentezlenmesi için peptit zincirinin kullanılmasıyla sentezlenebilir.Daha uzun peptidleri sentezlemek için hedef moleküllerin uygun parçalara bölünmesi ve C terminalindeki farklılaşma derecesini en aza indirebileceklerinin belirlenmesi gerekir.Bireysel parçalar kademeli olarak bir araya getirildikten sonra hedef bileşik birleştirilecektir.Peptit sentezi stratejisi, en iyi ve en uygun koruyucu fragmanın seçimini içerir ve peptid sentezi stratejisi, en uygun koruyucu baz kombinasyonunun seçimini ve en iyi fragman konjugasyon yöntemini içerir.
Gönderim zamanı: Temmuz-19-2023