Yüzeyde, peptit bağlarının oluşumu, dipeptitler veren basit bir kimyasal işlemdir. Bu, iki amino asit bileşeninin susuz kalırken bir amid bağı olan bir peptit bağı ile bağlandığı anlamına gelir.
Peptit bağı oluşumu, hafif reaksiyon koşulları altında bir amino asidin aktivasyonudur. (A) Karboksil kısmı, ikinci amino asit (B) Nükleofilik aktifleştirilmiş karboksil kısmı dipeptidi (A-B) oluşturur. “Karboksil bileşeni (A) korunmazsa, peptit bağının oluşumu kontrol edilemez.” Doğrusal ve siklik peptitler gibi yan ürünler hedef bileşik A-B ile karıştırılabilir. Bu nedenle, peptit bağı oluşumunda yer almayan tüm fonksiyonel gruplar, peptit sentezi sırasında geçici olarak geri dönüşümlü bir şekilde korunmalıdır.
Bu nedenle, peptit sentezi - her peptit bağının oluşumu - üç adım agregasyon içerir.
İlk adım, korumaya ihtiyaç duyan bazı amino asitler hazırlamaktır ve amino asitlerin zwitteriyonik yapısı artık mevcut değildir.
İkinci adım, N korumalı amino asidin karboksil grubunun önce aktif ara maddeye aktive edildiği ve daha sonra peptit bağı oluştuğu peptit bağları oluşturmak için iki aşamalı bir reaksiyondur. Bu birleştirilmiş reaksiyon ya tek aşamalı bir reaksiyon veya iki sıralı reaksiyon olarak ortaya çıkabilir.
Üçüncü adım, koruyucu tabanın seçici olarak çıkarılması veya tamamen çıkarılmasıdır. Tüm çıkarma ancak tüm peptit zincirleri birleştirildikten sonra meydana gelebilse de, peptit sentezine devam etmek için koruyucu grupların seçici olarak çıkarılması da gereklidir.
Çünkü 10 amino asit (Ser, THR, TRY, ASP, Glu, Lys, Arg, His, SEC ve CYS), seçici koruma gerektiren, peptit sentezini daha karmaşık hale getiren yan zincir fonksiyonel grupları içerir. Seçicilik için farklı gereksinimler nedeniyle geçici ve yarı kalıcı koruma tabanları ayırt edilmelidir. Geçici koruma grupları, bir sonraki adımda amino asit veya karboksil fonksiyonel gruplarının geçici korumasını yansıtmak için kullanılır. Yarı kalıcı koruyucu gruplar, halihazırda oluşturulmuş peptit bağlarına veya amino asit yan zincirlerine müdahale etmeden çıkarılır.
“İdeal olarak, karboksil bileşeninin aktivasyonu ve daha sonra peptit bağlarının (birleştirme reaksiyonları) oluşumu, rasemik veya yan ürün oluşumu olmadan hızlı olmalı ve yüksek verim elde etmek için molar reaktanlar uygulanmalıdır.” Ne yazık ki, kimyasal bağlantı yöntemlerinin hiçbiri bu gereksinimleri karşılamıyor ve çok azı pratik sentez için uygundur.
Peptit sentezi sırasında, çeşitli reaksiyonlarda yer alan fonksiyonel gruplar genellikle manuel merkeze bağlanır, glisin tek istisna ve potansiyel bir rotasyon riski vardır.
Peptit sentez döngüsünde son adım, tüm koruyucu grupların çıkarılmasıdır. Koruyucu grupların seçici olarak çıkarılması, dipeptit sentezinde korumanın tamamen uzaklaştırılması gereksinimine ek olarak peptit zinciri uzantısı için önemlidir. Sentetik stratejiler dikkatle planlanmalıdır. Stratejik seçime bağlı olarak, N a-amino veya karboksil koruyucu grupları seçici olarak kaldırabilir. “Strateji” terimi, bireysel amino asitlerin yoğuşma reaksiyonları dizisini ifade eder. Genel olarak, kademeli sentez ve fragman yoğunlaşması arasında bir fark vardır. Peptit sentezi (“geleneksel sentez” olarak da bilinir) çözeltide gerçekleşir. Çoğu durumda, peptit zincirinin kademeli olarak uzatılması, ancak daha kısa fragmanları sentezlemek için peptit zinciri kullanılarak sentezlenebilir. Daha uzun peptitleri sentezlemek için, hedef moleküller uygun fragmanlara ayrılmalı ve C terminalindeki farklılaşma derecesini en aza indirebileceklerini belirlemelidir. Bireysel fragmanlar kademeli olarak birleştirildikten sonra, hedef bileşik birleştirilecektir. Peptit sentezi stratejisi, en iyi ve en uygun koruyucu parçanın seçimini içerir ve peptit sentezi stratejisi, koruyucu bazların en uygun kombinasyonunun ve fragman konjugasyonunun en iyi yöntemini içerir.
Gönderme Zamanı: 2025-07-02