Birçok transmembran peptiti vardır ve bunların sınıflandırılması fiziksel ve kimyasal özelliklere, kaynaklara, yutma mekanizmalarına ve biyomedikal uygulamalara dayanmaktadır. Fiziksel ve kimyasal özelliklerine göre, membran nüfuz eden peptitler üç tipe ayrılabilir: katyonik, amfifilik ve hidrofobik. Katyonik ve amfifilik membran nüfuz eden peptitler%85, hidrofobik membran nüfuz eden peptitler sadece%15'dir.
1. katyonik membran nüfuz eden peptit
Katyonik transmembran peptitler, arginin, lizin ve histidin bakımından zengin kısa peptitlerden, Tat, Penetratin, Poliarginin, P22N, DPV3 ve DPV6 gibi histidinlerden oluşur. Bunlar arasında, arginin, hücre zarı üzerinde negatif yüklü fosforik asit gruplarıyla hidrojen bağlayabilen ve transmembran peptitlerini fizyolojik pH değeri koşulu altında membrana aracılık edebilen guanidin içerir. Oligarginin (3 R'den 12 R'ye) çalışmaları, membran penetrasyon kabiliyetinin sadece arginin miktarı 8'e kadar düşük olduğunda ve membran penetrasyon kabiliyetinin arginin miktarının artmasıyla kademeli olarak arttığını göstermiştir. Lizin, arginin gibi katyonik olsa da, guanidin içermez, bu nedenle tek başına varken, membran penetrasyon verimliliği çok yüksek değildir. Futaki ve ark. (2001) iyi membran penetrasyon etkisinin sadece katyonik hücre zarı penetrasyon peptitinin en az 8 pozitif yüklü amino asit içerdiğinde elde edilebileceğini bulmuşlardır. Penetrasyon peptitlerinin membrana nüfuz etmesi için pozitif yüklü amino asit kalıntıları gerekli olsa da, diğer amino asitler eşit derecede önemlidir, örneğin W14 F'ye uyum sağladığında, penetratinin penetrable kaybedilir.
Özel bir katyonik transmembran peptitleri sınıfı, arginin, lizin ve prolin bakımından zengin kısa peptitlerden oluşan ve nükleer gözenek kompleksi aracılığıyla çekirdeğe taşınabilen nükleer lokalizasyon dizileridir (NLS'ler). NLS'ler, sırasıyla bir ve iki temel amino asit kümesinden oluşan tek ve çift tiplemeye ayrılabilir. Örneğin, Simian Virus 40'dan (SV40) PKKKRKV, nükleer protein çift tip bir NL'dir. Krpaatkgqakkkl, membran transmembranda rol oynayabilen kısa dizidir. NLS'lerin çoğu 8'den az yük sayılarına sahip olduğundan, NLS'ler etkili transmembran peptitleri değildir, ancak amfifilik transmembran peptitleri oluşturmak için hidrofobik peptit sekanslarına kovalent olarak bağlandığında etkili transmembran peptitleri olabilirler.
2. Amfifilik transmembran peptidi
Amfifilik transmembran peptitleri, primer amfifilik, sekonder a-helal amfifilik, β-katlama amfifilik ve prolin ile zenginleştirilmiş amfifilik olarak bölünebilen hidrofilik ve hidrofobik alanlardan oluşur.
Birincil tip amfifilik aşınma membran peptitlerini iki kategoriye dönüştürmek, NLSS ile kategori, mpg (glaflgflgaagstmgawsqpkkkrkv) ve pep - 1 (ketwwetwwtewsqpkkkkv) gibi hidrofobik peptit sekansı ile birbirine bağlı olarak bağlanır, her ikisi de nükleer lokalizasyona dayanmaktadır, her ikisi de nükleer lokalizasyona dayanmaktadır. MPG'nin hidrofobik alanı, HIV glikoprotein 41'in (GalflgflGaAgstmg A) füzyon dizisi ile ilişkilidir ve PEP-1'in hidrofobik alanı, yüksek membran afinitesi (ketwwet wwtew) olan triptofan zengin kümesi ile ilişkilidir. Bununla birlikte, her ikisinin hidrofobik alanları, WSQP yoluyla nükleer lokalizasyon sinyali pKKKRKV ile bağlantılıdır. Bir başka primer amfifilik transmembran peptitleri sınıfı, PVEC, ARF (1-22) ve BPRPR (1-28) gibi doğal proteinlerden izole edildi.
Sekonder a-sarmal transmembran peptitleri, a-helisleri yoluyla membrana bağlanır ve bunların hidrofilik ve hidrofobik amino asit kalıntıları, MAP (Klalklalk alkaalkla) gibi sarmal yapının farklı yüzeylerinde bulunur. Beta peptit katlama tipi amfifilik aşınma membran için, beta pilili bir tabaka oluşturma yeteneği, membranın penetrasyon kabiliyeti için çok önemlidir (dpkgggdpkggvtvtvtvtgggggdpkpd gibi, membranın membranının penetrasyon kabiliyetinin araştırılamadığı süreçte, membranın kefareti kullanılamaz. Parça, membranın penetrasyon yeteneği çok zayıf. Prolin ile zenginleştirilmiş amfifilik transmembran peptitlerinde, poliprolin II (PPII), prolin polipeptit yapısında yüksek oranda zenginleştirildiğinde saf suda kolayca oluşur. PPII, dönüş başına 3.6 amino asit kalıntısına sahip standart sağ elini alfa-sarmal yapının aksine, dönüş başına 3.0 amino asit kalıntısına sahip solak bir sarmaldır. Prolin ile zenginleştirilmiş amfifilik transmembran peptitler arasında sığır antimikrobiyal peptit 7 (BAC7), sentetik polipeptid (PPR) N (N 3, 4, 5 ve 6 olabilir), vb.
3. Hidrofobik membran nüfuz eden peptit
Hidrofobik transmembran peptitleri, sadece polar olmayan amino asit kalıntıları içerir, net yük amino asit sekansının toplam yükünün% 20'sinden daha az veya transmembran için gerekli olan hidrofobik kısımlar veya kimyasal gruplar içerir. Bu hücresel transmembran peptitleri genellikle göz ardı edilmesine rağmen, Kaposi'nin sarkomundan fibroblast büyüme faktörü (K-FGF) ve fibroblast büyüme faktörü 12 (F-GF12) gibi mevcuttur.
Post süresi: 2025-07-01