Amino asitlere giriş

Amino asitler nelerdir?
Doğada en yaygın amino asitlere a-amino asitler denir. Bu moleküllerin merkezi karbon atomuna bağlı dört farklı ikame edicisi vardır (α-C atomu olarak adlandırılır):
Amino (NH₂, üç harfli kodu "H-" olarak kısaltılmıştır).
Karboksilik asit grubu (COOH, üç harfli kodda "-OH" olarak kısaltılmıştır).
Yan zincirler(Oldukça değişken olan ve amino asitlerin ve son peptidin özelliklerini belirleyen R).
Hidrojen atomu (H).
A-C atomlarının bu dört farklı gruba bağlantısı, amino asitlerin ve peptitlerin davranışını ve özelliklerini belirlemede önemli bir rol oynayan benzersiz kimyasal özellikler sağlar.

Amino asitlerin biyolojik aktivitesi
Amino asitler aşağıdakiler gibi biyolojik aktiviteler sergileyebilir:
Triptofan (TRP) ve glutamik asit (Glu) metabolik süreçlerde önemli bir rol oynar.
R grubu (veya yan zincir) amino asitlerin benzersiz özelliklerini belirler. Bu gruplar:
Basit bir ifadeyle:Glisin (GLY) gibi bir hidrojen atomu.
Diğer asitler dahildir: aspartik asit (ASP) ve glutamik asit (Glu) gibi.
Temel Grupları Taşıma:Arginin (Arg), lizin (Lys) veya histidin (HIS).
Kutup Grupları içerir: serin (Ser) veya treonin (thr) gibi.
Polar olmayan hidrokarbonlar:Alanin (ALA), fenilalanin (PHE) veya Valine (Val).
Sülfür İçeriği:Sistein (Cys) ve metiyonin (MET) 'de görüldüğü gibi.
L-amino asitlerin ve d-amino asitlerin rolü
A-C atomunun dört ikamesi, tetrahedronun köşelerinde, α-C atomu merkezde düzenlenmiştir (bakınız Şekil 3). Bu düzenleme, iki amino asit molekül formunun sol ve sağ ellere benzer şekilde ayna formunda var olmasını sağlar. Bu ayna formları "stereoizomerler" veya "enantiyomerler" olarak bilinir.
Enantiyomerlerin biyolojik önemi
Enantiyomerler neredeyse aynı kimyasal ve fiziksel özelliklere sahip olsa da, biyolojik etkileri önemli ölçüde farklılık gösterebilir. Moleküler şekil biyolojik hedeflerle etkileşimi için kritik öneme sahiptir. Bir enantiomer hedefe etkili bir şekilde bağlanabilir, diğeri olmayabilir veya bazı durumlarda olumsuz bir etkiye sahip olabilir. Çözeltide, enantiyomer polarize ışık düzlemini ters yönde döndürür.