Peptit kitaplığı türleri

Alanin Tarama Kütüphanesi
    Ala tarama peptit kütüphanesi, bir dizideki belirli amino asitlerin peptit fonksiyonu üzerindeki etkilerini tanımlamaya yönelik bir yöntemdir. Dizideki amino asitleri sırasıyla Ala ile değiştiriyoruz; Ala tarama peptid kütüphanesi aracılığıyla belirli amino asitlerin genel protein yapısı, işlevi ve diğer biyolojik aktiviteler üzerindeki etkisi belirlenebilir.

Konumsal Tarama Kitaplığı (PSL)
    Konumsal taramalı peptid kütüphanesi, peptid dizilerini optimize etmek için önemli bir araçtır. Bir peptidin seçilmiş bölgeleri veya bölgeleri yerine diğer amino asitleri sistematik olarak ikame eder ve bu bölgelerdeki optimal amino asitleri peptid aktivite analizleri yoluyla belirler. Bu tür bir peptit kütüphanesi, araştırmacıların belirli konumlarda belirli etkilere veya aktivitelere sahip belirli bölgeleri tanımlamasına yardımcı olur.

Çakışan Kitaplık

Örtüşen peptit kütüphanesi, doğrusal veya sürekli epitopların taranmasına yönelik yaygın bir yöntemdir. Peptit kütüphanesinin tasarımı temel olarak iki parametreyle belirlenir: peptit uzunluğu ve ofset sayısı. Protein, N terminalinden C terminaline doğru kesildiğinden, uçta yetim bir peptidin kalması mümkündür. Tutarlı uzunluğu korumak için, bir veya daha fazla amino asidin N terminalinden kaydırılmasını öneririz.

Kesme Peptit Kütüphaneleri

Kırpma peptid kütüphaneleri, bir peptid dizisi içindeki en kısa amino asit dizilerini tanımlamak için kullanılır. Kesilmiş peptid kitaplıklarının inşası tipik olarak amino asitlerin orijinal peptid dizisinin her iki ucundan sistematik olarak çıkarılmasını içerir. Bazı önemli amino asitler biliniyorsa, bu amino asitler muhafaza edilmelidir ve amino asitler daha sonra taramaya başlamak için peptidin diğer ucundan birer birer çıkarılır.

Rastgele Peptit Kütüphanesi

Rastgele peptit kütüphaneleri, 20 doğal amino asidi içerecek ve aynı anda seçilen amino asit kalıntılarını rastgele ikame edecek şekilde pompalı tüfek yaklaşımıyla tasarlanmıştır.

Şifreli Kütüphane

Karıştırılmış kitaplıkların tasarımı, orijinal peptit amino asit dizisinin dahili yeniden düzenlemelerine dayanmaktadır. En yüksek mutasyon derecesine sahip peptit kütüphanesidir. Bozulmuş peptitler, spesifik dizilerin protein fonksiyonu veya aktivitesi için kritik olduğunu göstermek amacıyla sıklıkla negatif kontroller olarak kullanılır. Aynı zamanda yeni hedefleri belirlemek için kullanılan rastgele bir tarama aracıdır.