Bu yazıda iki temel amino asit, glisin (Gly) ve alanin (Ala) tanıtılmaktadır.Bunun temel nedeni, baz amino asitler gibi davranabilmeleri ve bunlara gruplar eklenmesinin başka türde amino asitler oluşturabilmesidir.
Glisin özel bir tatlı tada sahiptir, bu nedenle İngilizce adı Yunanca glykys'den (tatlı) gelir.Glisinin Çince çevirisi sadece “tatlı” anlamına gelmekle kalmıyor, aynı zamanda “sadakat, başarı ve zarafet” modeli denebilecek benzer telaffuza da sahip.Tatlı tadı nedeniyle glisin, gıda endüstrisinde acıyı gidermek ve tatlılığı arttırmak için sıklıkla tatlandırıcı madde olarak kullanılır.Glisin yan zinciri küçüktür ve yalnızca bir hidrojen atomu içerir.Bu onu farklı kılıyor.Kiralitesi olmayan bazik bir amino asittir.
Proteinlerdeki glisin, küçük boyutu ve esnekliği ile karakterize edilir.Örneğin kolajenin üç sarmallı yapısı çok özeldir.Her iki kalıntı için bir glisin bulunmalıdır, aksi takdirde çok fazla sterik engellemeye neden olur.Benzer şekilde, bir proteinin iki alanı arasındaki bağlantı, konformasyonel esneklik sağlamak için sıklıkla glisine ihtiyaç duyar.Ancak glisin yeterince esnekse stabilitesi mutlaka yetersiz olur.
Glisin, α-helis oluşumu sırasındaki spoilerlardan biridir.Bunun nedeni, yan zincirlerin konformasyonu stabilize edemeyecek kadar küçük olmasıdır.Ek olarak, glisin sıklıkla tampon çözeltileri hazırlamak için kullanılır.Elektroforez yapanlarınız bunu sıklıkla hatırlar.
Alaninin İngilizce adı Almanca asetaldehit kelimesinden gelir ve alaninin üç karbon içermesi ve kimyasal adının alanin olması nedeniyle Çince isminin anlaşılması daha kolaydır.Bu, amino asidin karakteri gibi basit bir isimdir.Alaninin yan zinciri yalnızca bir metil grubuna sahiptir ve glisinden biraz daha büyüktür.Diğer 18 amino asidin yapısal formüllerini çizdiğimde alanine gruplar ekledim.Proteinlerde alanin bir tuğla gibidir, kimseyle çatışmayan ortak bir temel yapı malzemesidir.
Alaninin yan zincirinin çok az engeli vardır ve bir konformasyon olan α-sarmalında yer alır.β-katlandığında da oldukça stabildir.Protein mühendisliğinde, bir protein üzerinde belirli bir hedef olmadan bir amino asidi mutasyona uğratmak istiyorsanız, genellikle onu alanine dönüştürebilirsiniz; bu da proteinin genel konformasyonunu yok etmek kolay değildir.
Gönderim zamanı: Mayıs-29-2023